No inicio da colonização foram povoadas as regiões próximas do litoral, criadas as vilas, as cidades, as primeiras explorações do pau-brasil e posteriormente o cultivo de cana-de-açúcar e a introdução das primeiras cabeças de gado. Passado algum tempo, os colonizadores iniciaram a exploração no interior do território brasileiro, para a expansão dos seus negócios.
Entradas
Para explorar o interior, foram organizadas expedições oficiais. As entradas partiam do litoral com a finalidade de expandir as terras, aprisionar índios e escravizá-los e ainda descobrir minas de metais e pedras preciosas
Bandeiras
As bandeiras eram expedições não oficias, geralmente organizadas por fazendeiros, comerciantes, entre outros, que saiam de São Paulo e localidades vizinhas em busca de índios, de metais e de pedras preciosas. Eram grupos formados por colonos, mestiços, negros, índios, mulheres, crianças e padres, que recebiam o nome de bandeirantes.
Ao contrário do que ocorria nas entradas, nas bandeiras não havia respeito ao limite do Tratado de Tordesilhas, e foram atingidas terras de domínio espanhol. Os bandeirantes, em algumas missões, chegavam a ficar vários anos acampados em uma região. As bandeiras, de acordo com suas finalidades, podiam ser classificadas em:
Bandeiras de caça ao índio (século XVII)
Objetivo: caçar índios e vende-los aos engenhos de açúcar.
Bandeiras do ouro e do diamante (séculos XVII-XVIII)
Objetivo: procurar minas de metais e pedras preciosas.
Bandeiras de sertanismo de contrato
Objetivo: contratadas pelo governo para resgatar os índios que fugiam, combater e ameaça dos indígenas rebeldes os quilombos.
A planície Amazônica
Por causa da distancia dos principais centros econômicos como Pernambuco e Bahia, a região amazônica ficou abandonada. Por volta do século XVII, quando as expedições chegaram ao Rio Amazonas, essa região vinha sendo explorada por franceses, irlandeses, ingleses e holandeses, que contrabandeavam cacau, guaraná, castanha, pimenta e madeira. Foi então promovida a expulsão dos invasores. Durante muito tempo, os jesuítas doutrinaram os índios e exploraram essa região, obtendo grandes lucros.